Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nid1P10493 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nid1P10493 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nid1P10493 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nid1P10493 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nid1P10493 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nid1P10493 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nid1P10493 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nid1P10493 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nid1P10493 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nid1P10493 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nid1P10493 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid1P10493 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid1P10493 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms