Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl1P10146 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl1P10146 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl1P10146 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl1P10146 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms