Protein–RNA interactions for Protein: P0C192

Lrrc4b, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4bP0C192 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc4bP0C192 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc4bP0C192 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc4bP0C192 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc4bP0C192 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Lrrc4bP0C192 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc4bP0C192 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc4bP0C192 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc4bP0C192 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc4bP0C192 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms