Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb8P09632 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb8P09632 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxb8P09632 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxb8P09632 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb8P09632 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms