Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb1P09055 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb1P09055 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb1P09055 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb1P09055 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb1P09055 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms