Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrlP06879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrlP06879 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrlP06879 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrlP06879 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrlP06879 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrlP06879 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrlP06879 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrlP06879 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrlP06879 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrlP06879 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrlP06879 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrlP06879 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrlP06879 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrlP06879 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrlP06879 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrlP06879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrlP06879 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrlP06879 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrlP06879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrlP06879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrlP06879 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrlP06879 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrlP06879 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PrlP06879 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrlP06879 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrlP06879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrlP06879 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrlP06879 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrlP06879 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrlP06879 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrlP06879 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrlP06879 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrlP06879 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PrlP06879 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrlP06879 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrlP06879 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrlP06879 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrlP06879 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrlP06879 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrlP06879 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrlP06879 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrlP06879 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrlP06879 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrlP06879 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrlP06879 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrlP06879 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrlP06879 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrlP06879 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrlP06879 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrlP06879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrlP06879 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrlP06879 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrlP06879 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrlP06879 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrlP06879 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrlP06879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrlP06879 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrlP06879 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrlP06879 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrlP06879 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrlP06879 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrlP06879 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrlP06879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrlP06879 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrlP06879 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrlP06879 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrlP06879 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrlP06879 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrlP06879 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrlP06879 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrlP06879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrlP06879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrlP06879 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrlP06879 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrlP06879 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrlP06879 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrlP06879 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrlP06879 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrlP06879 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms