Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06329 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06329 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06329 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06329 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06329 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06329 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06329 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06329 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06329 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06329 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06329 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06329 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06329 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06329 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06329 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P06329 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06329 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06329 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06329 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06329 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06329 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06329 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06329 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06329 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06329 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06329 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06329 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06329 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06329 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06329 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06329 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06329 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06329 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06329 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06329 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06329 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06329 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06329 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06329 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06329 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06329 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06329 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06329 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06329 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06329 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06329 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms