Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt1P04104 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt1P04104 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt1P04104 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt1P04104 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt1P04104 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt1P04104 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt1P04104 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt1P04104 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt1P04104 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt1P04104 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms