Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01896 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01896 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01896 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01896 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01896 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01896 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01896 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01896 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01896 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01896 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01896 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01896 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01896 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01896 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01896 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01896 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01896 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01896 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01896 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01896 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01896 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01896 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01896 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01896 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01896 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01896 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01896 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01896 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01896 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01896 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01896 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01896 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01896 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01896 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01896 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01896 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01896 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01896 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01896 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01896 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01896 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01896 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01896 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01896 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01896 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms