Protein–RNA interactions for Protein: P01863

Ighg, Ig gamma-2A chain C region, A allele, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghgP01863 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IghgP01863 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IghgP01863 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IghgP01863 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IghgP01863 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IghgP01863 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IghgP01863 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IghgP01863 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IghgP01863 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IghgP01863 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IghgP01863 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IghgP01863 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IghgP01863 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IghgP01863 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IghgP01863 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IghgP01863 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IghgP01863 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IghgP01863 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IghgP01863 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IghgP01863 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IghgP01863 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IghgP01863 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IghgP01863 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IghgP01863 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IghgP01863 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IghgP01863 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IghgP01863 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IghgP01863 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IghgP01863 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IghgP01863 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IghgP01863 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IghgP01863 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IghgP01863 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IghgP01863 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IghgP01863 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IghgP01863 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IghgP01863 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IghgP01863 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IghgP01863 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IghgP01863 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IghgP01863 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IghgP01863 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IghgP01863 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IghgP01863 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IghgP01863 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IghgP01863 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IghgP01863 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IghgP01863 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IghgP01863 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IghgP01863 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IghgP01863 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IghgP01863 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IghgP01863 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IghgP01863 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IghgP01863 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IghgP01863 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IghgP01863 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IghgP01863 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IghgP01863 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IghgP01863 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IghgP01863 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IghgP01863 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IghgP01863 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IghgP01863 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IghgP01863 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IghgP01863 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IghgP01863 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IghgP01863 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IghgP01863 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IghgP01863 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IghgP01863 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IghgP01863 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IghgP01863 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IghgP01863 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IghgP01863 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IghgP01863 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IghgP01863 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IghgP01863 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IghgP01863 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IghgP01863 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IghgP01863 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IghgP01863 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms