Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01821 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01821 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01821 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01821 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01821 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01821 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01821 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01821 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01821 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01821 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01821 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01821 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01821 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01821 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01821 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01821 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01821 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01821 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01821 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01821 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01821 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01821 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01821 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01821 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01821 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01821 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01821 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01821 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01821 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01821 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01821 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01821 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01821 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01821 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01821 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01821 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01821 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01821 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01821 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01821 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01821 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01821 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01821 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01821 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms