Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01738 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01738 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01738 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01738 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01738 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
P01738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01738 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01738 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01738 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01738 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01738 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01738 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01738 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01738 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01738 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01738 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01738 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01738 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01738 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01738 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.2 ms