Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01652 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P01652 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01652 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01652 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
P01652 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P01652 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01652 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01652 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01652 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01652 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
P01652 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01652 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01652 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01652 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01652 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01652 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
P01652 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01652 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01652 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01652 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01652 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01652 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01652 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01652 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01652 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01652 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01652 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
P01652 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01652 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P01652 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01652 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01652 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01652 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01652 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01652 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01652 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01652 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01652 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01652 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01652 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01652 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01652 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01652 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01652 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01652 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P01652 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01652 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01652 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01652 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01652 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01652 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01652 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01652 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01652 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01652 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01652 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01652 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01652 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01652 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01652 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01652 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01652 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01652 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01652 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01652 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01652 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01652 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01652 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01652 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01652 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01652 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
P01652 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01652 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01652 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01652 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.2 ms