Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FosP01101 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FosP01101 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FosP01101 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FosP01101 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FosP01101 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FosP01101 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FosP01101 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FosP01101 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FosP01101 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FosP01101 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FosP01101 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FosP01101 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FosP01101 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FosP01101 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FosP01101 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FosP01101 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FosP01101 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FosP01101 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FosP01101 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FosP01101 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FosP01101 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FosP01101 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FosP01101 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FosP01101 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FosP01101 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FosP01101 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FosP01101 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FosP01101 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FosP01101 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FosP01101 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FosP01101 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FosP01101 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FosP01101 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FosP01101 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FosP01101 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FosP01101 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FosP01101 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FosP01101 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FosP01101 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FosP01101 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FosP01101 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FosP01101 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FosP01101 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FosP01101 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FosP01101 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FosP01101 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FosP01101 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FosP01101 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FosP01101 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FosP01101 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FosP01101 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FosP01101 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FosP01101 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FosP01101 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FosP01101 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FosP01101 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FosP01101 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FosP01101 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FosP01101 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FosP01101 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FosP01101 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FosP01101 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FosP01101 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FosP01101 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FosP01101 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FosP01101 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FosP01101 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FosP01101 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FosP01101 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FosP01101 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FosP01101 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FosP01101 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FosP01101 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FosP01101 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FosP01101 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FosP01101 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FosP01101 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FosP01101 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FosP01101 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FosP01101 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FosP01101 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FosP01101 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FosP01101 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FosP01101 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FosP01101 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FosP01101 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FosP01101 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FosP01101 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FosP01101 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FosP01101 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FosP01101 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosP01101 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms