Protein–RNA interactions for Protein: O88890

Sh2d1a, SH2 domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1aO88890 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Sh2d1aO88890 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Sh2d1aO88890 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15,98■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Sh2d1aO88890 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,95■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,93■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15,92■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Sh2d1aO88890 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,7 ms