Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JtbO88824 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JtbO88824 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JtbO88824 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JtbO88824 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JtbO88824 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JtbO88824 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JtbO88824 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JtbO88824 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JtbO88824 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JtbO88824 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JtbO88824 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JtbO88824 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JtbO88824 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JtbO88824 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JtbO88824 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JtbO88824 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JtbO88824 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JtbO88824 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JtbO88824 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JtbO88824 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JtbO88824 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JtbO88824 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JtbO88824 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JtbO88824 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JtbO88824 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JtbO88824 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JtbO88824 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JtbO88824 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JtbO88824 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JtbO88824 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JtbO88824 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JtbO88824 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JtbO88824 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JtbO88824 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JtbO88824 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JtbO88824 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JtbO88824 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JtbO88824 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JtbO88824 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JtbO88824 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JtbO88824 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JtbO88824 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
JtbO88824 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JtbO88824 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
JtbO88824 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JtbO88824 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JtbO88824 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JtbO88824 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JtbO88824 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JtbO88824 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JtbO88824 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JtbO88824 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JtbO88824 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms