Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BlmO88700 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BlmO88700 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BlmO88700 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BlmO88700 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BlmO88700 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
BlmO88700 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BlmO88700 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BlmO88700 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BlmO88700 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BlmO88700 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BlmO88700 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BlmO88700 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BlmO88700 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BlmO88700 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BlmO88700 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BlmO88700 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BlmO88700 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BlmO88700 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BlmO88700 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BlmO88700 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BlmO88700 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BlmO88700 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BlmO88700 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BlmO88700 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BlmO88700 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BlmO88700 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BlmO88700 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
BlmO88700 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BlmO88700 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BlmO88700 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BlmO88700 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BlmO88700 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BlmO88700 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BlmO88700 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BlmO88700 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BlmO88700 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
BlmO88700 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BlmO88700 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BlmO88700 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BlmO88700 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BlmO88700 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
BlmO88700 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BlmO88700 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
BlmO88700 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BlmO88700 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BlmO88700 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BlmO88700 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BlmO88700 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BlmO88700 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
BlmO88700 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BlmO88700 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
BlmO88700 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BlmO88700 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BlmO88700 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BlmO88700 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BlmO88700 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BlmO88700 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BlmO88700 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BlmO88700 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BlmO88700 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BlmO88700 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BlmO88700 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BlmO88700 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BlmO88700 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BlmO88700 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BlmO88700 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
BlmO88700 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BlmO88700 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BlmO88700 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BlmO88700 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BlmO88700 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BlmO88700 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
BlmO88700 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BlmO88700 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BlmO88700 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BlmO88700 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BlmO88700 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BlmO88700 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BlmO88700 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BlmO88700 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BlmO88700 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BlmO88700 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BlmO88700 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms