Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3aO88508 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnmt3aO88508 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3aO88508 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3aO88508 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3aO88508 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms