Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dync1i1O88485 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dync1i1O88485 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dync1i1O88485 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dync1i1O88485 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dync1i1O88485 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dync1i1O88485 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms