Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdh7O88451 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdh7O88451 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdh7O88451 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdh7O88451 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rdh7O88451 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh7O88451 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdh7O88451 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rdh7O88451 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh7O88451 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh7O88451 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh7O88451 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh7O88451 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh7O88451 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms