Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc1O88447 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc1O88447 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc1O88447 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc1O88447 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc1O88447 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klc1O88447 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc1O88447 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc1O88447 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc1O88447 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klc1O88447 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Klc1O88447 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms