Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkcO88445 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkcO88445 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AurkcO88445 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AurkcO88445 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AurkcO88445 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkcO88445 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkcO88445 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AurkcO88445 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AurkcO88445 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AurkcO88445 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AurkcO88445 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AurkcO88445 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms