Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnal1O88327 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnal1O88327 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnal1O88327 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnnal1O88327 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms