Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd2O70572 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd2O70572 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd2O70572 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd2O70572 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd2O70572 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd2O70572 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd2O70572 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms