Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp3O70494 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp3O70494 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp3O70494 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp3O70494 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp3O70494 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp3O70494 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp3O70494 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp3O70494 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp3O70494 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms