Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp8O70404 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp8O70404 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms