Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf5O70191 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf5O70191 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf5O70191 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf5O70191 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf5O70191 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf5O70191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf5O70191 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf5O70191 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf5O70191 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf5O70191 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf5O70191 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf5O70191 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf5O70191 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf5O70191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf5O70191 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf5O70191 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf5O70191 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf5O70191 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf5O70191 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms