Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
StrnO55106 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
StrnO55106 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
StrnO55106 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
StrnO55106 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
StrnO55106 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
StrnO55106 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
StrnO55106 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StrnO55106 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StrnO55106 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
StrnO55106 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
StrnO55106 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
StrnO55106 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
StrnO55106 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
StrnO55106 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
StrnO55106 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
StrnO55106 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
StrnO55106 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StrnO55106 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
StrnO55106 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
StrnO55106 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
StrnO55106 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
StrnO55106 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
StrnO55106 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
StrnO55106 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
StrnO55106 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
StrnO55106 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StrnO55106 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StrnO55106 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StrnO55106 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StrnO55106 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
StrnO55106 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
StrnO55106 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
StrnO55106 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
StrnO55106 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
StrnO55106 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
StrnO55106 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
StrnO55106 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
StrnO55106 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
StrnO55106 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
StrnO55106 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
StrnO55106 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StrnO55106 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StrnO55106 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
StrnO55106 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
StrnO55106 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StrnO55106 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
StrnO55106 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
StrnO55106 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
StrnO55106 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
StrnO55106 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
StrnO55106 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
StrnO55106 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
StrnO55106 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StrnO55106 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StrnO55106 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StrnO55106 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
StrnO55106 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
StrnO55106 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
StrnO55106 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
StrnO55106 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
StrnO55106 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
StrnO55106 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
StrnO55106 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
StrnO55106 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
StrnO55106 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StrnO55106 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StrnO55106 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StrnO55106 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
StrnO55106 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
StrnO55106 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
StrnO55106 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
StrnO55106 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
StrnO55106 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
StrnO55106 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StrnO55106 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StrnO55106 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StrnO55106 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
StrnO55106 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StrnO55106 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StrnO55106 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
StrnO55106 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
StrnO55106 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
StrnO55106 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
StrnO55106 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
StrnO55106 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
StrnO55106 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms