Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NlkO54949 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NlkO54949 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NlkO54949 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NlkO54949 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NlkO54949 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NlkO54949 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NlkO54949 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NlkO54949 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NlkO54949 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NlkO54949 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NlkO54949 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NlkO54949 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NlkO54949 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NlkO54949 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NlkO54949 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NlkO54949 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NlkO54949 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NlkO54949 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NlkO54949 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NlkO54949 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NlkO54949 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NlkO54949 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NlkO54949 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NlkO54949 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NlkO54949 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NlkO54949 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NlkO54949 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NlkO54949 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NlkO54949 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NlkO54949 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NlkO54949 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NlkO54949 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NlkO54949 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NlkO54949 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NlkO54949 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NlkO54949 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NlkO54949 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NlkO54949 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NlkO54949 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NlkO54949 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NlkO54949 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NlkO54949 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NlkO54949 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NlkO54949 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NlkO54949 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NlkO54949 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NlkO54949 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NlkO54949 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NlkO54949 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NlkO54949 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NlkO54949 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NlkO54949 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NlkO54949 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NlkO54949 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NlkO54949 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NlkO54949 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NlkO54949 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NlkO54949 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NlkO54949 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NlkO54949 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NlkO54949 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NlkO54949 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NlkO54949 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NlkO54949 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NlkO54949 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NlkO54949 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NlkO54949 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NlkO54949 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NlkO54949 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NlkO54949 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NlkO54949 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NlkO54949 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NlkO54949 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NlkO54949 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NlkO54949 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NlkO54949 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NlkO54949 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NlkO54949 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NlkO54949 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms