Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmb10O35955 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb10O35955 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb10O35955 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb10O35955 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb10O35955 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb10O35955 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb10O35955 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb10O35955 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb10O35955 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb10O35955 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb10O35955 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb10O35955 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb10O35955 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmb10O35955 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psmb10O35955 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms