Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FxnO35943 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FxnO35943 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FxnO35943 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FxnO35943 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FxnO35943 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FxnO35943 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FxnO35943 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FxnO35943 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FxnO35943 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FxnO35943 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FxnO35943 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FxnO35943 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FxnO35943 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FxnO35943 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FxnO35943 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FxnO35943 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FxnO35943 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FxnO35943 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FxnO35943 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FxnO35943 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FxnO35943 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FxnO35943 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FxnO35943 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FxnO35943 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FxnO35943 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FxnO35943 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FxnO35943 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FxnO35943 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FxnO35943 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FxnO35943 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FxnO35943 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FxnO35943 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FxnO35943 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FxnO35943 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FxnO35943 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FxnO35943 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FxnO35943 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FxnO35943 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FxnO35943 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FxnO35943 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FxnO35943 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FxnO35943 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FxnO35943 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FxnO35943 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FxnO35943 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FxnO35943 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FxnO35943 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FxnO35943 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FxnO35943 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FxnO35943 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FxnO35943 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FxnO35943 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FxnO35943 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FxnO35943 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FxnO35943 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FxnO35943 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FxnO35943 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FxnO35943 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FxnO35943 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FxnO35943 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FxnO35943 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms