Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Timm44O35857 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Timm44O35857 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Timm44O35857 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Timm44O35857 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Timm44O35857 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Timm44O35857 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Timm44O35857 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Timm44O35857 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Timm44O35857 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Timm44O35857 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Timm44O35857 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms