Protein–RNA interactions for Protein: O35730

Ring1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ring1O35730 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ring1O35730 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ring1O35730 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ring1O35730 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ring1O35730 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ring1O35730 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ring1O35730 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ring1O35730 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ring1O35730 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ring1O35730 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ring1O35730 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ring1O35730 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ring1O35730 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ring1O35730 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ring1O35730 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ring1O35730 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ring1O35730 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ring1O35730 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ring1O35730 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ring1O35730 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms