Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold2O35654 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold2O35654 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold2O35654 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold2O35654 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold2O35654 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold2O35654 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold2O35654 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold2O35654 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold2O35654 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold2O35654 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold2O35654 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold2O35654 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold2O35654 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pold2O35654 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pold2O35654 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pold2O35654 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pold2O35654 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pold2O35654 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pold2O35654 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pold2O35654 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms