Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rabep1O35551 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rabep1O35551 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rabep1O35551 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rabep1O35551 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rabep1O35551 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rabep1O35551 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rabep1O35551 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rabep1O35551 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rabep1O35551 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rabep1O35551 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rabep1O35551 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rabep1O35551 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rabep1O35551 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rabep1O35551 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms