Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a2O35488 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a2O35488 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc27a2O35488 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc27a2O35488 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms