Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccrl2O35457 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccrl2O35457 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccrl2O35457 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccrl2O35457 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms