Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cpsf2O35218 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf2O35218 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf2O35218 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpsf2O35218 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms