Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Pitx3O35160 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Pitx3O35160 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18,69■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,58
Pitx3O35160 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18,64■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Pitx3O35160 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms