Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atn1O35126 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atn1O35126 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atn1O35126 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atn1O35126 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atn1O35126 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atn1O35126 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atn1O35126 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atn1O35126 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atn1O35126 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atn1O35126 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atn1O35126 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atn1O35126 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms