Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sypl1O09117 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl1O09117 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sypl1O09117 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sypl1O09117 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms