Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms