Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcm2O09102 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcm2O09102 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcm2O09102 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcm2O09102 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms