Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snap23O09044 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Snap23O09044 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snap23O09044 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Snap23O09044 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snap23O09044 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snap23O09044 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Snap23O09044 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snap23O09044 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snap23O09044 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snap23O09044 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snap23O09044 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms