Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra2O08842 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gfra2O08842 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra2O08842 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms