Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcshO08795 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrkcshO08795 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcshO08795 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkcshO08795 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms