Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MttpO08601 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MttpO08601 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MttpO08601 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MttpO08601 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MttpO08601 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MttpO08601 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MttpO08601 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MttpO08601 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MttpO08601 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MttpO08601 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MttpO08601 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MttpO08601 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MttpO08601 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MttpO08601 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MttpO08601 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MttpO08601 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MttpO08601 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MttpO08601 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MttpO08601 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MttpO08601 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MttpO08601 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MttpO08601 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MttpO08601 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MttpO08601 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MttpO08601 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MttpO08601 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MttpO08601 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MttpO08601 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MttpO08601 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MttpO08601 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MttpO08601 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MttpO08601 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MttpO08601 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MttpO08601 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MttpO08601 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MttpO08601 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MttpO08601 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MttpO08601 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MttpO08601 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MttpO08601 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MttpO08601 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MttpO08601 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MttpO08601 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MttpO08601 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MttpO08601 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MttpO08601 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MttpO08601 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MttpO08601 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MttpO08601 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MttpO08601 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MttpO08601 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MttpO08601 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MttpO08601 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MttpO08601 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MttpO08601 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MttpO08601 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MttpO08601 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MttpO08601 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MttpO08601 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MttpO08601 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MttpO08601 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MttpO08601 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MttpO08601 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MttpO08601 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MttpO08601 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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