Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3383J3QQ59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3383J3QQ59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3383J3QQ59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3383J3QQ59 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3383J3QQ59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3383J3QQ59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3383J3QQ59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3383J3QQ59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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