Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm9602J3QPD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9602J3QPD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm9602J3QPD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9602J3QPD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms