Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2035J3QP87 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2035J3QP87 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2035J3QP87 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2035J3QP87 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms